北大高性能计算平台“未名生科一号”正式上线。
计算机的名字里面怎么会有“生科”?
所谓高性能究竟有多高?
一起来看看!
“未名生科一号”缘何以“生科”为名?
“未名生科一号” 虽然是“一号”,但却是北京大学高性能计算校级公共平台上建设的第三套超算系统了,它诞生之时已经有了两个“哥哥”,分别是“大哥”未名一号和“二哥”未名教学一号。
那么,作为“三弟”的第三套超算系统,他的名字当中为何出现了“一号”呢?原因就在于这套系统将聚焦生命科学及其相关前沿交叉学科的需要,要优先服务于冷冻电镜平台的科研工作。从这角度理解,它确实称得上是北大在生命科学领域的“第一号”超算系统。
北京大学冷冻电镜实验室设备
那么,“冷冻电镜”又是什么呢?简单解释的话,这就一项用“速冻”技术固定住蛋白质等生物大分子,进而通过电子显微镜观察其空间结构的技术。这项技术的诞生,促进了结构生物学的蓬勃发展,2017年的诺贝尔化学奖,就颁发给了三位在冷冻电镜技术上作出突出贡献的科学家。
2017年诺贝尔化学奖得主: Jacques Dubochet, Joachim Frank和Richard Henderson,获奖理由是“研发出冷冻电镜,用于溶液中生物分子结构的高分辨率测定”
冷冻电镜有三个关键因素:冷冻固定技术,显微技术,摩臣,以及对图像数据进行收集和处理的技术,而高性能计算平台正是实现图像数据收集和处理的重要基础。具体来说,从电子显微镜拍下的“照片”到立体的生物分子结构,这中间就需要超级计算机的能力了。所以,“未名生科一号”今后的主要工作就是解析出电镜拍摄到的很多二维照片与生物大分子的三维空间结构之间的关系。
当然,作为一个强大的超算系统,“未名生科一号”也会为其他学科领域提供不低于30%的公共机时。据介绍,这将有效缓解高性能计算平台首套系统“未名一号”的排队情况,为广大师生营造更加优质的高性能计算环境。